Em 11 de fevereiro de 1966, o então Arcebispo de São Paulo, Cardeal Agnelo Rossi, dividiu a Arquidiocese de São Paulo em quatro regiões episcopais: Centro, Oeste, Norte e Leste. Cada uma estaria a cargo de um Bispo Auxiliar com a finalidade de descentralizar o trabalho pastoral e estar mais próximo dos Padres e do povo. No mesmo ano, Dom José Lafayete Ferreira Alves foi nomeado Vigário Episcopal para a Região Centro.
Em 1967, Dom Agnelo nomeou Monsenhor José de Matos Pereira, da Congregação dos Missionários Filhos do Coração Imaculado de Maria, Vigário Episcopal na Região Centro.
Em 1º de Novembro de 1970, Dom Paulo Evaristo Arns tomou posse como quinto Arcebispo Metropolitano de São Paulo, e, em 1973, nomeou Vigário Episcopal para a Região Centro Frei Vicente de Andrade Peluso, Dominicano, pároco da paroquia Santa Rosa de Lima nas Perdizes, Frei Vicente falecido no dia 25 de junho 1990. Em 25 de janeiro de 1975, a Arquidiocese passou a contar com novos Bispos Auxiliares, e Dom Paulo reservou para si a responsabilidade da Região Centro, assessorado por Dom José Thurler, nascido em Nova Friburgo 16 junho 1913, ordenação sacerdotal 04 abril 1942, nomeado 1º Bispo Diocesano de Chapecó SC em 26 abril 1952, posse canônica em Chapecó 26 abril 1959, nomeado bispo coadjutor de Sorocaba em 22 março 1962, posse canônica em Sorocaba 10 junho 1962. Transferido para São Paulo, aqui permaneceu ate sua morte aos 78 anos no dia 23 abril 1992.
Em 1977, pela primeira vez aparece nos documentos referência à Região Episcopal Sé no lugar de Região Centro. Em agosto de 1978, Dom Paulo nomeia Cônego Décio Pereira, nascido em São Paulo no dia 15 de Abril de 1940, recebeu a ordenação sacerdotal no dia 22 de janeiro de 1967 pelo Cardeal Rossi, Em agosto de 1978, Dom Paulo Evaristo, o nomeia Vigário Episcopal da Região Sé, depois foi nomeado bispo auxiliar de São Paulo no dia 02 de abril de 1979 , sendo ordenado bispo em 27 de maio de 1979, trabalhou na região sé de 17 junho 1979 ate 13 de março de 1989, sendo nesta data transferido para a Região Episcopal Belém permanecendo ate 21 maio 1997, quando é nomeado 3º Bispo Diocesano de Santo André e recebeu a posse canônica no dia 29 de junho de 1997 e em Santo André permaneceu até seu falecimento aos 62 anos no dia 05 de fevereiro 2003.
Dom Antônio Gaspar nasceu em São Paulo no dia 11 novembro 1931, foi ordenado sacerdote 08 setembro 1962, Em 06 dezembro 1982 , Monsenhor Antônio Gaspar é nomeado Vigário Episcopal para a Região Sé, recebendo a Ordenação Episcopal no dia 06 fevereiro 1983, até ser transferido como 4º Bispo Diocesano de Barretos e recebendo a posse canônica no dia 03 março 2001 tornou-se emérito no dia 09 de janeiro 2008. Na Região Episcopal Sé foi substituído pelo
Monsenhor Manuel Parrado Carral, nascido na Espanha no dia 29 Setembro 1946, recebeu a Ordenação Sacerdotal 10 dezembro 1972 e no dia 03 de janeiro 2001, foi nomeado bispo auxiliar de São Paulo , recebendo a ordenação episcopal no dia 10 de março de 2001, e sendo acolhido na Região Episcopal Sé no dia 11 março 2001 , foi nomeado 2º Bispo Diocesano de São Miguel Paulista no dia 23 de fevereiro de 2008, se despediu da Região Episcopal Sé no dia 23 de fevereiro de 2008 e recebeu posse canônica em 02 março 2008
Com a transferência de Dom Manuel para São Miguel Paulista , o Papa Bento 16 nomeou no dia 23 de janeiro de 2008, o salesiano,
Padre Tarcisio Scaramussa, SDB, para Bispo Auxiliar de São Paulo. Monsenhor Tarcisio, nasceu em Prosperidade ES, 19 setembro 1950, recebeu a ordenação sacerdotal 11 dezembro 1977 e a ordenação episcopal 19 abril 2008, sendo acolhido na Região Episcopal Sé no dia 19 abril 2006. Foi nomeado bispo coadjutor de Santos no dia 16 de julho 2014, se despediu da arquidiocese de São Paulo no dia 09 de Setembro de 2014 e tomou posse como 6º Bispo Diocesano de Santos.
Padre Aparecido Silva, Pároco na Igreja do Santíssimo Sacramento, assumiu a função de Vigário Episcopal até a nomeação de Dom Eduardo Vieira dos Santos.
Dom Eduardo Vieira dos Santos, nasceu em Bom Sucesso, PR, 18 março 1965, foi ordenado sacerdote 15 dezembro 2000, nomeado bispo auxiliar de São Paulo 10 dezembro 2014, recebeu a Ordenação Episcopal no dia 07 de fevereiro de 2015 e foi acolhido pela Região Episcopal Sé no dia seguinte 08 fevereiro 2015
Dom José Lafayete Ferreira Alves
Dom José Thurler
Dom Décio Pereira
Dom Antônio Gaspar
Dom Manuel Parrado Carral
